直接原位PCR技术

作者: 时间:2023-05-17 点击数:

实验方法原理

原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。

试剂

福尔马林、二甲苯、PBS、Tris-HCl、Triton-X100、蛋白酶K、PCR反应缓冲液、Tag酶、Tween-20、指甲油、无水乙醇、苏木素染色液、NP-40、NaCl、MgCl2、BSA、DAB、过氧化氢、盐酸酒精液

仪器耗材

玻片、湿盒、滤纸、显微镜

实验步骤

一、组织切片和细胞样品的制备

1. 试剂与配置

10%福尔马林;二甲苯;PBS。

2. 操作方法

(1)用10%福尔马林固定组织8~15 h,石蜡包埋,切片(4 μm),将切片置于新鲜的二甲苯中处理5 min,放入无水乙醇中浸泡5 min,取出,空气干燥;

(2) 对于培养细胞,可直接制备爬片,也可有PBS洗细胞一次,加10%福尔马林静置过夜,用橡胶刮下细胞;用PBS洗细胞两次,2 000 rpm×3 min,用5 ml PBS重悬细胞,即可用甩片机甩片或直接吸50 μl点在载玻片上。

二、切片预处理(蛋白酶消化)

1. 试剂与配置

0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4)

缓冲液A:0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4),0.3% Tween-20,0.5% NP-40

蛋白酶K:20-50μ g/ml,溶于TE中

2. 操作方法

(1)干燥后的切片置于0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4)中,室温孵育5 min;

(2)浸入缓冲液A中,室温孵育10 min;

(3) 滴加20 μl蛋白酶K液于标本上,在湿盒中37℃孵育20 min;

(4)在室温下,用0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.4)漂洗两次,每次5m in。

三、原位扩增(以标记生物素为例)

1. 试剂与配置

PCR反应缓冲液:两种引物各100pmol,dATP、dCTP、dGTP和dTTP各200μmol, Bio-dUTP 50mol,1×PCR缓冲液;

Tag酶:5U/μl

缓冲液B:0.01mol/L PBS,0.1% Triton-X100

指甲油(市售)

无水乙醇

2. 操作方法

(1)切片用1×PCR缓冲液平衡3次,每次5 min;

(2) 用滤纸吸去切片上多余的液体,置60℃,每片加入30 μl PCR反应缓冲液,5 U Tag酶,用盖玻片封片,四周封以指甲油,防止蒸发;

(3) 94℃变性5 min,按下列条件(94℃×2 min,55℃×2 min,72℃×3 min)循环20~25次后,72℃延伸5 min;

(4)玻片浸入无水乙醇中10 min,以软化指甲油;

(5) 用刀片撬开盖玻片并除去;

(6) 用缓冲液B漂洗两次,每次3 min;

(7)用无水乙醇固定5 min,并吹干。

四、检测(以ABC法为例)

1. 试剂与配置

缓冲液C:0.1 mol/L Tris-HCl (pH7.5),0.1 mol/LNaCl,2 mmol/L MgCl2, 0.5% Triton-X100

封闭液:3%BSA(溶于缓冲液C中)

显色液:0.05%DAB,溶于0.05 mol/L Tris-HCl (pH7.4),临用前每10 ml加30%过氧化氢50 μl。

1%盐酸酒精液

苏木素染色液

2. 操作方法

(1) 用30 μl 3%BSA滴加在玻片上,封闭1 h;

(2)用缓冲液C简洗1 min,每片滴加ABC复合物20~30 μl,室温放置40 min;

(3)缓冲液B室温漂洗3次,每次15 min;

(4) 滴加显色液于玻片上,镜下观察控制显色时间(一般7~14 min);

(5)流水洗片,浸入苏木素液中复染30 s,1%盐酸酒精分化(提抽2次);

(6) 常规脱水、透明、封片,镜下观察。

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