大量的研究表明线粒体与细胞凋亡密切相关,其中线粒体跨膜电位（△y）的破坏,被认为是细胞凋亡级联反应过程中最早发生的事件之一,它发生在细胞核凋亡特征（染色质浓缩、DNA断裂）出现之前,一旦线粒体跨膜电位崩溃,则细胞凋亡不可逆转.
JC-1(5,5’,6,6’-tetrachloro-1,1’,3,3’-tetraethylbenzimidazolcarbocyanine iodide)是一种阳离子脂质荧光染料,可作为检测线粒体跨膜电位指示剂.JC-1有单体和多聚体两种存在状态,在低浓度时以单体的形式存在,高浓度时以多聚体形式存在,两者的发射光谱不同,但均可在流式细胞仪绿色（FL-1）通道检测出绿色荧光,JC-1可透过正常细胞膜以单体状态聚集胞内,正常健康线粒体的膜电位（△y）具有极性,JC-1依赖于△y的极性被迅速摄入线粒体内,并因浓度增高而在线粒体内形成多聚体,多聚体发射光为红色荧光；可被流式细胞仪的红色（FL-2）通道检测到,而细胞发生凋亡时,线粒体跨膜电位被去极化,JC-1从线粒体内释放,红光强度减弱,以单体的形式存在于胞质内发绿色荧光.根椐这一特征检测线粒体膜电位的变化.
所需仪器或者试剂：流式细胞仪或荧光显微镜、高速离心机、CO2培养箱、微量移液器、1.5m L Microtube、载玻片、盖玻片（荧光显微镜观察需用）、PBS、灭菌去离子水
3． 细胞培养的数量不宜超过1×106,否则细胞会产生自然凋亡影响检测.
4． 对PH变化过于敏感的细胞建议用胎牛血清取代Buffer孵育染色及洗涤,或延长观测时间
5． 流式细胞仪检测线粒体膜电位变化受到多种因素的影响,因诱导剂、细胞株类型,作用时间的不同而荧光强度比例都有不同,因此没有通用标准的补偿设门指南,因此每个试验需设阴性及阳性对照组进行荧光补偿及设门.
6． 组织需先制备单细胞悬液或提取纯化线粒体后方可进行检测,可选用凯基细胞悬液制备试剂盒（KGA829）或线粒体提取试剂盒（KGA827）.
1． 用适当的方法诱导细胞凋亡,同时设立阴性对照组和阳性对照组【用适当的凋亡诱导剂（如星形孢菌素,staurosporine）,诱导适当时间后经其它检测（如AnnexinV或 Caspase 3活性）证实确有凋亡产生】,收集细胞；
2． 用PBS洗涤细胞二次（离心2000rpm,5min）,收集不多于1×106的细胞；
3． 取100μL 10× Incubation Buffer加900μL灭菌去离子水稀释成1× Incubation Buffer,混匀并预热至37℃；
4． 吸取500μL 1× Incubation Buffer,加入1μL JC-1,涡旋混匀配成JC-1工作液；
【因JC-1在水中的溶解度很小,所以可以通过离心的方法（10,000rpm,1min）去除不溶的颗粒,吸取离心后的上清使用,以消除干扰】
5． 取500μL JC-1工作液将细胞均匀悬浮,37℃,5%CO2的培养箱中孵育15~20min；
6． 室温离心（2000rpm,5min）收集细胞,用1× Incubation Buffer洗两次；
7． 吸取500μL 1× Incubation Buffer重新悬浮细胞；
1． 滴一滴上述细胞悬液于载玻片,盖上盖玻片,于荧光显微镜下观察；
2． 对于贴壁细胞来说,也可直接用盖玻片来培养细胞并诱导细胞凋亡；用PBS洗涤细胞两次；
滴加100μL JC-1工作液,加盖玻片,37℃,5%CO2的培养箱中孵育15~20min；1× Incubation Buffe洗涤1~2遍；将盖玻片倒置于载玻片上,于荧光显微镜下观察；
正常细胞：双色滤光片观察则为：绿++ 红++（高绿高红）,如在同一滤光片下观察则为黄绿色
凋亡细胞：双色滤光片观察则为：绿++ 红+（高绿低红）, 如在同一滤光片下观察则为绿色
用流式细胞仪检测（Ex=488 nm; Em=530 nm）细胞凋亡的情况,绿色荧光通过FITC通道通常为FL1来检测；红色荧光通过PI通道通常为FL2来检测..正常细胞{FL-1亮,FL-2亮; R1},凋亡细胞 {FL-1亮, FL-2暗; R2},设门的位置根椐细胞种类、实验条件等不同而变化,试验需设未经处理的正常细胞为阴性对照组和阳性对照组,根椐阴性和阳性对照组的双参数散点图来设定门的位置.
